Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430402E10RikQ9D3N5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms