Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arv1Q9D0U9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arv1Q9D0U9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms