Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2e1Q9D0D5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms