Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms