Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfdn1Q9CWM4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn1Q9CWM4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms