Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms