Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms