Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRQ99707 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRQ99707 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRQ99707 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRQ99707 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRQ99707 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTRQ99707 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTRQ99707 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRQ99707 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRQ99707 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRQ99707 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRQ99707 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRQ99707 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRQ99707 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRQ99707 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRQ99707 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRQ99707 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRQ99707 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRQ99707 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRQ99707 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRQ99707 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRQ99707 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRQ99707 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRQ99707 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRQ99707 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRQ99707 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRQ99707 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRQ99707 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRQ99707 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRQ99707 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRQ99707 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRQ99707 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRQ99707 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRQ99707 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRQ99707 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRQ99707 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRQ99707 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRQ99707 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRQ99707 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRQ99707 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRQ99707 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRQ99707 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRQ99707 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRQ99707 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRQ99707 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRQ99707 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRQ99707 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRQ99707 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRQ99707 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRQ99707 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRQ99707 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRQ99707 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRQ99707 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRQ99707 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRQ99707 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRQ99707 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRQ99707 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRQ99707 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRQ99707 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRQ99707 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRQ99707 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRQ99707 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRQ99707 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRQ99707 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRQ99707 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRQ99707 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRQ99707 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRQ99707 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRQ99707 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRQ99707 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRQ99707 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRQ99707 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRQ99707 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRQ99707 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRQ99707 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRQ99707 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRQ99707 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRQ99707 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms