Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms