Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SptssbQ925E8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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