Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc12Q8K5B8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms