Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc2Q8BZW8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms