Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra5Q8BHJ7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra5Q8BHJ7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms