Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Htatsf1Q8BGC0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htatsf1Q8BGC0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms