Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG22

Clca2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca2Q8BG22 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca2Q8BG22 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca2Q8BG22 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca2Q8BG22 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca2Q8BG22 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca2Q8BG22 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca2Q8BG22 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Clca2Q8BG22 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms