Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChfrQ810L3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChfrQ810L3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChfrQ810L3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChfrQ810L3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChfrQ810L3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChfrQ810L3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChfrQ810L3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChfrQ810L3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ChfrQ810L3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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