Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF550Q7Z398 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF550Q7Z398 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms