Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Rph3alQ768S4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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