Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms