Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L2Q6R6M4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L2Q6R6M4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms