Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CilpQ66K08 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CilpQ66K08 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms