Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc5a6Q5U4D8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc5a6Q5U4D8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms