Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brip1Q5SXJ3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brip1Q5SXJ3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms