Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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