Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933416C03RikQ3V063 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4933416C03RikQ3V063 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4933416C03RikQ3V063 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4933416C03RikQ3V063 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4933416C03RikQ3V063 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933416C03RikQ3V063 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933416C03RikQ3V063 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933416C03RikQ3V063 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933416C03RikQ3V063 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms