Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCINQ13939 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCINQ13939 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCINQ13939 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCINQ13939 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCINQ13939 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCINQ13939 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCINQ13939 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCINQ13939 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCINQ13939 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCINQ13939 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCINQ13939 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCINQ13939 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCINQ13939 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCINQ13939 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCINQ13939 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCINQ13939 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCINQ13939 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCINQ13939 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCINQ13939 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCINQ13939 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCINQ13939 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCINQ13939 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCINQ13939 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCINQ13939 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCINQ13939 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCINQ13939 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCINQ13939 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCINQ13939 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCINQ13939 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCINQ13939 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCINQ13939 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCINQ13939 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCINQ13939 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCINQ13939 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCINQ13939 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCINQ13939 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCINQ13939 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCINQ13939 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCINQ13939 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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CCINQ13939 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCINQ13939 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCINQ13939 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCINQ13939 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CCINQ13939 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCINQ13939 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CCINQ13939 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CCINQ13939 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CCINQ13939 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CCINQ13939 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCINQ13939 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCINQ13939 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCINQ13939 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCINQ13939 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCINQ13939 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCINQ13939 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCINQ13939 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCINQ13939 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCINQ13939 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCINQ13939 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCINQ13939 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCINQ13939 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCINQ13939 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCINQ13939 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCINQ13939 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCINQ13939 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCINQ13939 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCINQ13939 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCINQ13939 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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