Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFX1Q12986 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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