Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha4Q03137 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Epha4Q03137 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms