Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfiaQ02780 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NfiaQ02780 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms