Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx2P80206 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx2P80206 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx2P80206 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx2P80206 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx2P80206 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otx2P80206 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms