Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-24P63145 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms