Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paxbp1P58501 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Paxbp1P58501 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms