Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox2P48432 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox2P48432 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox2P48432 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox2P48432 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox2P48432 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox2P48432 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox2P48432 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox2P48432 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox2P48432 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox2P48432 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox2P48432 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox2P48432 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox2P48432 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms