Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbx2P48031 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms