Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtf1A2AQ19 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtf1A2AQ19 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
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