Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tcea2Q9QVN7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcea2Q9QVN7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms