Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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