Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cul3Q9JLV5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms