Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms