Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933421I07RikQ9D420 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933421I07RikQ9D420 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms