Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gtf2a1Q99PM3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2a1Q99PM3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms