Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtn4Q99P72 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtn4Q99P72 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms