Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ms4a6bQ99N09 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ms4a6bQ99N09 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ms4a6bQ99N09 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ms4a6bQ99N09 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ms4a6bQ99N09 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ms4a6bQ99N09 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ms4a6bQ99N09 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ms4a6bQ99N09 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ms4a6bQ99N09 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ms4a6bQ99N09 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ms4a6bQ99N09 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ms4a6bQ99N09 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ms4a6bQ99N09 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ms4a6bQ99N09 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ms4a6bQ99N09 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ms4a6bQ99N09 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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