Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME2

Wdr6, WD repeat-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr6Q99ME2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr6Q99ME2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr6Q99ME2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms