Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chmp1b1Q99LU0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms