Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MEIS3Q99687 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MEIS3Q99687 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms