Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms