Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGLYRP2Q96PD5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms