Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RBM17Q96I25 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM17Q96I25 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM17Q96I25 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM17Q96I25 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM17Q96I25 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM17Q96I25 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM17Q96I25 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM17Q96I25 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM17Q96I25 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM17Q96I25 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBM17Q96I25 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms