Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TSR2Q969E8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms